Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snrpd1P62315 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpd1P62315 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snrpd1P62315 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snrpd1P62315 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms