Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SnrpeP62305 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpeP62305 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpeP62305 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms