Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snap25P60879 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snap25P60879 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snap25P60879 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snap25P60879 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snap25P60879 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Snap25P60879 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snap25P60879 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snap25P60879 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snap25P60879 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap25P60879 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snap25P60879 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snap25P60879 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snap25P60879 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snap25P60879 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snap25P60879 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snap25P60879 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snap25P60879 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap25P60879 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap25P60879 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms