Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P58686 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P58686 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P58686 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
P58686 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P58686 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
P58686 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
P58686 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
P58686 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
P58686 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P58686 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P58686 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
P58686 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
P58686 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
P58686 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
P58686 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
P58686 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
P58686 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P58686 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P58686 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
P58686 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
P58686 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P58686 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
P58686 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P58686 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P58686 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P58686 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
P58686 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
P58686 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P58686 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P58686 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P58686 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
P58686 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P58686 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P58686 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
P58686 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P58686 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P58686 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P58686 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P58686 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P58686 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P58686 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P58686 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P58686 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
P58686 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
P58686 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P58686 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P58686 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
P58686 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
P58686 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P58686 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P58686 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
P58686 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P58686 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P58686 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P58686 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
P58686 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P58686 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P58686 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P58686 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P58686 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P58686 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P58686 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P58686 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P58686 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P58686 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P58686 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P58686 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P58686 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P58686 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P58686 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P58686 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P58686 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
P58686 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P58686 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P58686 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P58686 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
P58686 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P58686 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P58686 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P58686 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P58686 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P58686 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P58686 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P58686 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P58686 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P58686 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P58686 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P58686 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P58686 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P58686 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P58686 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P58686 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P58686 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P58686 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P58686 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P58686 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P58686 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P58686 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P58686 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms