Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Samsn1P57725 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Samsn1P57725 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Samsn1P57725 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Samsn1P57725 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms