Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CckbrP56481 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CckbrP56481 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CckbrP56481 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CckbrP56481 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CckbrP56481 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CckbrP56481 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CckbrP56481 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CckbrP56481 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CckbrP56481 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CckbrP56481 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CckbrP56481 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CckbrP56481 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CckbrP56481 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CckbrP56481 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CckbrP56481 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CckbrP56481 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CckbrP56481 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CckbrP56481 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CckbrP56481 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CckbrP56481 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CckbrP56481 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CckbrP56481 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CckbrP56481 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CckbrP56481 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CckbrP56481 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CckbrP56481 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CckbrP56481 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms