Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CnbpP53996 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CnbpP53996 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CnbpP53996 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CnbpP53996 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CnbpP53996 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CnbpP53996 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CnbpP53996 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CnbpP53996 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CnbpP53996 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CnbpP53996 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CnbpP53996 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CnbpP53996 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CnbpP53996 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CnbpP53996 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CnbpP53996 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CnbpP53996 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CnbpP53996 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CnbpP53996 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CnbpP53996 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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