Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PctpP53808 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PctpP53808 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PctpP53808 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PctpP53808 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PctpP53808 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PctpP53808 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PctpP53808 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PctpP53808 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PctpP53808 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PctpP53808 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PctpP53808 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PctpP53808 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PctpP53808 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PctpP53808 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PctpP53808 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PctpP53808 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PctpP53808 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PctpP53808 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PctpP53808 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PctpP53808 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PctpP53808 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PctpP53808 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PctpP53808 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PctpP53808 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PctpP53808 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PctpP53808 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PctpP53808 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PctpP53808 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PctpP53808 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PctpP53808 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PctpP53808 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PctpP53808 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PctpP53808 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PctpP53808 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PctpP53808 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PctpP53808 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PctpP53808 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PctpP53808 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PctpP53808 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PctpP53808 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PctpP53808 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PctpP53808 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PctpP53808 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PctpP53808 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PctpP53808 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PctpP53808 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PctpP53808 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PctpP53808 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PctpP53808 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PctpP53808 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PctpP53808 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PctpP53808 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PctpP53808 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PctpP53808 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PctpP53808 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PctpP53808 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PctpP53808 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PctpP53808 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PctpP53808 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PctpP53808 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PctpP53808 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PctpP53808 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PctpP53808 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PctpP53808 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PctpP53808 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PctpP53808 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PctpP53808 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PctpP53808 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PctpP53808 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PctpP53808 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PctpP53808 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PctpP53808 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PctpP53808 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PctpP53808 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PctpP53808 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PctpP53808 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PctpP53808 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PctpP53808 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PctpP53808 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PctpP53808 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PctpP53808 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PctpP53808 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PctpP53808 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PctpP53808 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PctpP53808 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PctpP53808 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PctpP53808 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PctpP53808 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PctpP53808 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PctpP53808 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PctpP53808 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PctpP53808 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PctpP53808 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PctpP53808 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PctpP53808 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PctpP53808 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PctpP53808 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PctpP53808 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PctpP53808 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms