Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fdft1P53798 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fdft1P53798 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms