Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxc13P50207 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc13P50207 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc13P50207 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms