Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmod1P49813 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmod1P49813 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmod1P49813 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms