Protein–RNA interactions for Protein: P46471

Psmc2, 26S proteasome regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc2P46471 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Psmc2P46471 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psmc2P46471 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Psmc2P46471 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psmc2P46471 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms