Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vps26aP40336 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vps26aP40336 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vps26aP40336 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms