Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SsbP32067 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SsbP32067 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SsbP32067 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SsbP32067 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SsbP32067 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SsbP32067 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SsbP32067 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SsbP32067 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SsbP32067 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SsbP32067 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SsbP32067 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SsbP32067 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SsbP32067 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SsbP32067 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SsbP32067 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SsbP32067 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SsbP32067 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SsbP32067 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SsbP32067 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SsbP32067 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SsbP32067 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SsbP32067 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SsbP32067 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SsbP32067 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SsbP32067 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SsbP32067 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SsbP32067 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SsbP32067 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SsbP32067 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SsbP32067 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SsbP32067 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SsbP32067 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SsbP32067 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SsbP32067 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SsbP32067 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SsbP32067 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SsbP32067 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SsbP32067 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SsbP32067 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SsbP32067 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SsbP32067 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SsbP32067 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SsbP32067 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SsbP32067 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SsbP32067 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SsbP32067 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SsbP32067 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SsbP32067 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SsbP32067 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SsbP32067 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SsbP32067 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SsbP32067 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SsbP32067 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SsbP32067 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SsbP32067 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SsbP32067 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SsbP32067 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SsbP32067 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SsbP32067 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SsbP32067 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SsbP32067 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SsbP32067 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SsbP32067 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SsbP32067 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SsbP32067 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SsbP32067 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SsbP32067 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SsbP32067 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SsbP32067 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SsbP32067 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SsbP32067 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SsbP32067 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SsbP32067 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SsbP32067 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SsbP32067 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SsbP32067 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SsbP32067 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SsbP32067 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SsbP32067 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SsbP32067 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SsbP32067 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SsbP32067 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SsbP32067 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SsbP32067 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SsbP32067 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SsbP32067 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SsbP32067 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SsbP32067 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SsbP32067 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SsbP32067 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SsbP32067 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SsbP32067 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SsbP32067 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SsbP32067 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SsbP32067 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SsbP32067 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SsbP32067 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SsbP32067 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SsbP32067 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms