Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa11P31311 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa11P31311 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxa11P31311 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxa11P31311 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms