Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtmaP26350 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtmaP26350 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtmaP26350 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtmaP26350 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtmaP26350 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtmaP26350 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtmaP26350 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtmaP26350 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtmaP26350 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtmaP26350 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtmaP26350 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtmaP26350 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtmaP26350 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtmaP26350 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PtmaP26350 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtmaP26350 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtmaP26350 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtmaP26350 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtmaP26350 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtmaP26350 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtmaP26350 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PtmaP26350 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtmaP26350 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtmaP26350 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms