Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl13aP19253 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpl13aP19253 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl13aP19253 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms