Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata1P17679 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gata1P17679 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gata1P17679 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata1P17679 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gata1P17679 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata1P17679 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gata1P17679 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata1P17679 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata1P17679 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata1P17679 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata1P17679 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata1P17679 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata1P17679 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gata1P17679 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata1P17679 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata1P17679 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata1P17679 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gata1P17679 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms