Protein–RNA interactions for Protein: P17439

Gba, Glucosylceramidase, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GbaP17439 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GbaP17439 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GbaP17439 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GbaP17439 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GbaP17439 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GbaP17439 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GbaP17439 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GbaP17439 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GbaP17439 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GbaP17439 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GbaP17439 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GbaP17439 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GbaP17439 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GbaP17439 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GbaP17439 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GbaP17439 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GbaP17439 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GbaP17439 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GbaP17439 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GbaP17439 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GbaP17439 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GbaP17439 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GbaP17439 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GbaP17439 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GbaP17439 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GbaP17439 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GbaP17439 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GbaP17439 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GbaP17439 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GbaP17439 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GbaP17439 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GbaP17439 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GbaP17439 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GbaP17439 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GbaP17439 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GbaP17439 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GbaP17439 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GbaP17439 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GbaP17439 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GbaP17439 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GbaP17439 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GbaP17439 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GbaP17439 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GbaP17439 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GbaP17439 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GbaP17439 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GbaP17439 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GbaP17439 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GbaP17439 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GbaP17439 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GbaP17439 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GbaP17439 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GbaP17439 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GbaP17439 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GbaP17439 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GbaP17439 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GbaP17439 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GbaP17439 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GbaP17439 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GbaP17439 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GbaP17439 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GbaP17439 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GbaP17439 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GbaP17439 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GbaP17439 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GbaP17439 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GbaP17439 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GbaP17439 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GbaP17439 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GbaP17439 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GbaP17439 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GbaP17439 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GbaP17439 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GbaP17439 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GbaP17439 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GbaP17439 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GbaP17439 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GbaP17439 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GbaP17439 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GbaP17439 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GbaP17439 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GbaP17439 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GbaP17439 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GbaP17439 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GbaP17439 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GbaP17439 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GbaP17439 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GbaP17439 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GbaP17439 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GbaP17439 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GbaP17439 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GbaP17439 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GbaP17439 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GbaP17439 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GbaP17439 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GbaP17439 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GbaP17439 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GbaP17439 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GbaP17439 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GbaP17439 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms