Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hoxd4P10628 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd4P10628 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd4P10628 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Hoxd4P10628 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms