Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxd3P09027 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxd3P09027 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd3P09027 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms