Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01797 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01797 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01797 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01797 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01797 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01797 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01797 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01797 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01797 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01797 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01797 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01797 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01797 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01797 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01797 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01797 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01797 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01797 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01797 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01797 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01797 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01797 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01797 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01797 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01797 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01797 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01797 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01797 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01797 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01797 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01797 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01797 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01797 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01797 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01797 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01797 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01797 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01797 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01797 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01797 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01797 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01797 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01797 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01797 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01797 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01797 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01797 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01797 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01797 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01797 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01797 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01797 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01797 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01797 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01797 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01797 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01797 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01797 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01797 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01797 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01797 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01797 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01797 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01797 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01797 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01797 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01797 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01797 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01797 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01797 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01797 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01797 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01797 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01797 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01797 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01797 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01797 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01797 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01797 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01797 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01797 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01797 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P01797 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01797 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01797 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01797 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01797 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01797 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01797 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01797 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01797 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01797 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01797 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01797 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01797 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01797 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01797 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01797 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01797 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms