Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01793 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01793 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01793 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01793 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01793 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01793 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
P01793 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01793 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01793 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
P01793 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01793 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01793 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01793 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01793 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01793 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01793 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01793 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01793 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01793 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01793 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01793 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01793 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01793 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01793 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01793 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01793 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01793 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01793 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01793 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01793 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01793 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01793 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01793 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01793 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01793 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01793 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01793 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01793 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01793 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01793 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01793 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01793 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01793 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01793 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01793 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01793 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01793 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01793 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01793 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01793 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01793 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01793 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01793 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01793 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01793 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01793 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01793 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01793 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01793 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01793 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01793 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01793 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01793 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01793 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01793 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01793 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01793 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01793 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01793 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01793 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01793 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01793 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01793 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01793 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01793 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01793 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01793 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01793 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01793 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01793 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01793 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01793 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01793 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01793 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01793 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01793 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01793 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01793 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01793 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01793 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01793 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01793 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01793 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01793 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01793 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01793 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01793 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01793 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01793 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms