Protein–RNA interactions for Protein: P01573

Ifna2, Interferon alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna2P01573 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna2P01573 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna2P01573 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna2P01573 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ifna2P01573 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna2P01573 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna2P01573 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna2P01573 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna2P01573 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ifna2P01573 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ifna2P01573 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ifna2P01573 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ifna2P01573 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ifna2P01573 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms