Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Orc4O88708 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Orc4O88708 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Orc4O88708 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Orc4O88708 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Orc4O88708 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Orc4O88708 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Orc4O88708 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Orc4O88708 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Orc4O88708 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Orc4O88708 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Orc4O88708 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Orc4O88708 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms