Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dll3O88516 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dll3O88516 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Dll3O88516 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dll3O88516 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dll3O88516 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dll3O88516 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dll3O88516 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dll3O88516 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dll3O88516 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dll3O88516 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dll3O88516 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dll3O88516 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dll3O88516 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dll3O88516 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dll3O88516 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dll3O88516 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Dll3O88516 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms