Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sorl1O88307 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sorl1O88307 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms