Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cfdp1O88271 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cfdp1O88271 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cfdp1O88271 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms