Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Vamp4O70480 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Vamp4O70480 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Vamp4O70480 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Vamp4O70480 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Vamp4O70480 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms