Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChadO55226 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChadO55226 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChadO55226 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChadO55226 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChadO55226 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChadO55226 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChadO55226 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChadO55226 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChadO55226 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChadO55226 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChadO55226 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChadO55226 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ChadO55226 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChadO55226 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChadO55226 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChadO55226 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChadO55226 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChadO55226 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChadO55226 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChadO55226 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChadO55226 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChadO55226 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChadO55226 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChadO55226 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChadO55226 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChadO55226 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChadO55226 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChadO55226 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChadO55226 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChadO55226 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChadO55226 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChadO55226 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ChadO55226 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChadO55226 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ChadO55226 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChadO55226 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChadO55226 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChadO55226 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChadO55226 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChadO55226 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChadO55226 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChadO55226 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChadO55226 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChadO55226 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChadO55226 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChadO55226 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChadO55226 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ChadO55226 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChadO55226 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChadO55226 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChadO55226 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChadO55226 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChadO55226 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ChadO55226 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChadO55226 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChadO55226 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChadO55226 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChadO55226 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChadO55226 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChadO55226 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChadO55226 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChadO55226 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChadO55226 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChadO55226 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChadO55226 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChadO55226 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChadO55226 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChadO55226 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChadO55226 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChadO55226 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChadO55226 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChadO55226 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChadO55226 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChadO55226 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChadO55226 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChadO55226 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChadO55226 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ChadO55226 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ChadO55226 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChadO55226 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChadO55226 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ChadO55226 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChadO55226 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChadO55226 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChadO55226 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChadO55226 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChadO55226 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChadO55226 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChadO55226 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChadO55226 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChadO55226 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ChadO55226 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChadO55226 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChadO55226 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChadO55226 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ChadO55226 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChadO55226 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChadO55226 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ChadO55226 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.4 ms