Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pja1O55176 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pja1O55176 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pja1O55176 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pja1O55176 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pja1O55176 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pja1O55176 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pja1O55176 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pja1O55176 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pja1O55176 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pja1O55176 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pja1O55176 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pja1O55176 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pja1O55176 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pja1O55176 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pja1O55176 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pja1O55176 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pja1O55176 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pja1O55176 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pja1O55176 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pja1O55176 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms