Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BckdkO55028 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BckdkO55028 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
BckdkO55028 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BckdkO55028 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BckdkO55028 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BckdkO55028 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BckdkO55028 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BckdkO55028 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BckdkO55028 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BckdkO55028 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BckdkO55028 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BckdkO55028 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms