Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cldn5O54942 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn5O54942 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn5O54942 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn5O54942 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms