Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Psmb10O35955 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Psmb10O35955 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Psmb10O35955 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Psmb10O35955 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms