Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dsg3O35902 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dsg3O35902 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Dsg3O35902 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dsg3O35902 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms