Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad7O35253 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad7O35253 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad7O35253 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smad7O35253 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad7O35253 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad7O35253 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smad7O35253 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad7O35253 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad7O35253 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad7O35253 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad7O35253 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms