Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bhlhe40O35185 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bhlhe40O35185 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bhlhe40O35185 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms