Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Efna5O08543 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efna5O08543 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efna5O08543 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efna5O08543 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Efna5O08543 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efna5O08543 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Efna5O08543 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Efna5O08543 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Efna5O08543 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Efna5O08543 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Efna5O08543 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Efna5O08543 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Efna5O08543 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Efna5O08543 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efna5O08543 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efna5O08543 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efna5O08543 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Efna5O08543 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Efna5O08543 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efna5O08543 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efna5O08543 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efna5O08543 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Efna5O08543 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efna5O08543 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Efna5O08543 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Efna5O08543 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Efna5O08543 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms