Protein–RNA interactions for Protein: L7N277

Gm7942, Predicted gene 7942, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7942L7N277 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm7942L7N277 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm7942L7N277 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm7942L7N277 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm7942L7N277 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm7942L7N277 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms