Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm2888K7N746 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2888K7N746 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms