Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a18J3QN01 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a18J3QN01 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a18J3QN01 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a18J3QN01 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a18J3QN01 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a18J3QN01 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ms4a18J3QN01 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a18J3QN01 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a18J3QN01 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms