Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm17535J3KMR8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm17535J3KMR8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm17535J3KMR8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm17535J3KMR8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm17535J3KMR8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm17535J3KMR8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm17535J3KMR8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm17535J3KMR8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm17535J3KMR8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm17535J3KMR8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm17535J3KMR8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms