Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pabpc4lG5E8X2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pabpc4lG5E8X2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Pabpc4lG5E8X2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc4lG5E8X2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms