Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.29■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
5830473C10RikF8VQ07 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
5830473C10RikF8VQ07 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
5830473C10RikF8VQ07 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
5830473C10RikF8VQ07 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms