Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
BicraF8VPZ9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
BicraF8VPZ9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
BicraF8VPZ9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC41.16■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC41.13■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.18
BicraF8VPZ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
BicraF8VPZ9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
BicraF8VPZ9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
BicraF8VPZ9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
BicraF8VPZ9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
BicraF8VPZ9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
BicraF8VPZ9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
BicraF8VPZ9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
BicraF8VPZ9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
BicraF8VPZ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
BicraF8VPZ9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
BicraF8VPZ9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
BicraF8VPZ9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
BicraF8VPZ9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC41.08■■■■■ 4.17
BicraF8VPZ9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
BicraF8VPZ9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
BicraF8VPZ9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
BicraF8VPZ9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
BicraF8VPZ9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
BicraF8VPZ9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
BicraF8VPZ9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
BicraF8VPZ9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
BicraF8VPZ9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
BicraF8VPZ9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
BicraF8VPZ9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
BicraF8VPZ9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
BicraF8VPZ9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
BicraF8VPZ9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
BicraF8VPZ9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
BicraF8VPZ9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
BicraF8VPZ9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
BicraF8VPZ9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.16
BicraF8VPZ9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
BicraF8VPZ9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC40.95■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
BicraF8VPZ9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
BicraF8VPZ9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC40.88■■■■■ 4.13
BicraF8VPZ9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
BicraF8VPZ9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
BicraF8VPZ9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
BicraF8VPZ9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms