Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm8220F6YKI2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm8220F6YKI2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm8220F6YKI2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm8220F6YKI2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms