Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm5218F6YH22 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm5218F6YH22 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm5218F6YH22 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms