Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SmgcF6VRN1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SmgcF6VRN1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SmgcF6VRN1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms