Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rnf212F6TQD1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf212F6TQD1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf212F6TQD1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms