Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Urb2E9Q7L1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Urb2E9Q7L1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Urb2E9Q7L1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Urb2E9Q7L1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Urb2E9Q7L1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Urb2E9Q7L1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Urb2E9Q7L1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Urb2E9Q7L1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Urb2E9Q7L1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Urb2E9Q7L1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Urb2E9Q7L1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Urb2E9Q7L1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Urb2E9Q7L1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Urb2E9Q7L1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Urb2E9Q7L1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms